南京理工大學自動化學院前身，是原中國人民解放軍軍事工程學院炮兵工程系的隨動系統(tǒng)和指揮儀專業(yè)。歷經三十余年不斷調整，于1984年正式建系，2005年底成立學院。作為南京理工大學主要院系之一，自動化學院以復雜系統(tǒng)控制、火力控制、導航制導控制、模式識別及智能控制和控制工程見長，并致力于發(fā)展新一代基于物聯(lián)網控制和信息技術的基礎研究和創(chuàng)新探索。

        自動化學院在國家科技研發(fā)中發(fā)揮著重要的作用，先后承擔國家自然科學基金項目、國家“863”高技術項目、國家兵器型號項目和國防科技預研項目等200余項。同時，學院與省市地方各級企業(yè)建立了廣泛而緊密的合作，以最新的技術和成果服務于社會。學院與美國休斯敦大學、新加坡南洋理工大學、香港大學等國內外十余所著名高校保持長期合作關系，通過青年教師和學生的雙向交流和學術合作，為人才培養(yǎng)創(chuàng)造了良好的條件和環(huán)境。